Rémy, jeune rat, rêve d'être un grand chef cuisinier. Il débarque par hasard à Paris, dans les cuisines d'un très grand cuisinier. Dans cet univers interdit, truffé de pièges et de dangers, Rémy se lie d'amitié avec Linguini, un jeune commis chargé de sortir les poubelles. Celui-ci n'est autre que le fils caché du célèbre Gusteau, l'ancien propriétaire du restaurant. Pour aider son ami à récupérer son héritage, Rémy va se révéler plein de ressources et de talent...