Le secret de Haruhi aété révélé. Désormais, les membres du host club mettent tout en oeuvre pour protéger la place de leur camarade au lycée et maintenir l'illusion auprès des habituées du cercle. Cette mission s'avère toute fois difficile lorsque le groupe organise un séjour à la mer pour les vacances, car Tamaki a décidé, contre toute attente, d'inviter les clientes. Par ailleurs, la rentrée s'annoncera tout aussi mouvementée, puisque des jeunes Pilles de l'institut Sainte-Lobélie vont soudainement s'intéresser à Haruhi !