Le monde d'Arata bascule le jour où un cataclysme connu sous le nom de « phénomène destructif » Frappe sa ville et expédie sa cousine Hijiri dans une autre dimension. Pour en apprendre davantage sur ce mystérieux phénomène et retrouver sa cousine, Arata intègre l'école royale Biblia. Il y Fait la rencontre de sept Filles sublimes et surpuissantes : les mages du Trinity Seven !