Sir Alfred Wallace, le grand naturaliste du XIXe siècle a mis en évidence qu'une ligne frontière séparait la flore et la faune de l'Asie et de l'Océanie.
Les scientifiques de La Boudeuse ont mené une mission de collectes et d'inventaires : plantes, insectes, roches, etc. afin d'approfondir les connaissances de part et d'autre de cette «ligne de Wallace».
Cette nouvelle aventure conduit l'équipage dans les archipels des Calamians et des Sémirara aux Philippines, une région du monde qui compte des milliers d'îles isolées et perdues, aux mers infestées de pirates.